Jonah Hex est le plus impitoyable des chasseurs de primes, redouté dans tout l'Ouest. Condamné à la solitude après une histoire personnelle violente, Jonah ne fréquente que l'envoûtante Lilah, qui vit de ses charmes. Le sombre passé de Jonah ressurgit soudain quand l'armée américaine lui fait une offre qu'il ne peut pas refuser : le mandat d'arrêt le concernant sera annulé s'il arrive à éliminer un terroriste, Turnbull. L'homme qui a tué sa famille et qui l'a défiguré au fer rouge, doté d'une arme de destruction massive, s'apprête à commettre un massacre. Une lutte à mort s'engage entre les deux hommes.