Lorsqu'un agent du FBI sollicite son aide pour neutraliser une bombre découverte près des Nations Unies, ce qu'il fait en utilisant uniquement une corde et une clé à molette, MacGyver reconnaît la signature du "Fantôme". Ce fabriquant d'explosifs est responsable de la mort de son instructeur et mentor en Afghanistan, voilà cinq ans. Aujourd'hui, il tente de semer la pagaille et la peur lors d'une conférence pour la paix aux Nations Unies...