Jim Phelps, un agent de l'IMF, est chargé d'une mission à Prague à la demande de Kittridge de la CIA. Il doit récupérer la moitié de la liste N.O.C. volée par Alexander Golitzyn. La liste contient des noms de codes et des noms réels d'agents infiltrés en Europe de l'Est. Lors d'une réception à l'ambassade, Golitzyn doit voler la deuxième liste. Jim et son équipe se lancent dans l'opération, mais tout tourne mal et ils sont éliminés, sauf Ethan Hunt. Ethan est alors immédiatement accusé d'être le traître...