Jake revient après sa mission sous couverture pour le FBI, mais c'est pour découvrir que Terry ne le considère pas comme un véritable ami. Tandis que ses subalternes se disputent pour la moindre broutille, le capitaine Holt doit mettre en oeuvre la restructuration du commissariat, faire face à une inspection des affaires internes et subir les flagorneries de Charles. Les histoires d'amour entre Jake et Sophia ou entre Teddy et Amy compromettent grandement la concentration de l'équipe. Or Holt n'a qu'une ambition : mettre sous les verrous un insaisissable baron de la drogue. Après deux Golden Globes et un Emmy Award, "Brooklyn Nine-Nine" était reconduite pour une seconde saison encore plus fantaisiste.