Al tente de sauver le projet "Code Quantum", qu'une commission gouvernementale envisage de fermer pour raisons budgétaires. S'il venait à échouer, son ami Sam Beckett serait perdu dans l'espace-temps. Quant au scientifique, il continue de voyager au fil des ans, devenant tour à tour une femme, un aveugle, un handicapé mental ou encore un joueur de football américain. Plus longue que la précédente, cette deuxième saison valut à Dean Stockwell un Golden Globe en 1990 dans la catégorie meilleur acteur dans un second rôle. Le créateur de la série, Donald P Bellisario, et sa femme jouent dans le onzième épisode.