Jérémie est embarrassé par le comportement de plus en plus humain de la réplique de William, et fait part de ses craintes à ses amis. Malheureusement, leur conversation est surprise par Milly et Tamiya, qui, croyant tenir un scoop, se mettent en tête de questionner le faux William. Celui-ci conduit les deux jeunes reporters à l'usine. Parallèlement, les Lyoko-guerriers partent en mission afin de détruire le supercalculateur d'une base située dans le désert du Nouveau-Mexique. Mais la mission est interrompue lorsque le vrai William fait son apparition...