Sensei Wu, est un ancien rescapé de la première guerre des serpents et en possession de quatre armes d'or. Son premier élève est Cole à qui il donne la faux de terre, puis Wu rencontre Jay (ninja bleu et maître de la foudre) et Zane (ninja blanc puis de titane et maître de la glace). Le Sensei finit par trouver Kai (ninja rouge et maître du feu) et sa sœur Nya (samurai X puis ninja et maître de l'eau). Ils doivent donc combattre de nombreux ennemis (Les tribus serpentines, Garmadon, Overlord numérique, Chen, Moro...) pour sauver Ninjago. Zane parvient à infiltrer le repaire des fils de Garmadon. Killow le défie dans une course de motos.