Le divorce d'Alan a été prononcé. La garde de Jake donne lieu à de nombreuses difficultés. Les souvenirs d'enfance partagés par Charlie et Alan ne sont pas de tout repos non plus. Le second mari d'Evelyn meurt mais elle ne reste pas longtemps inactive. Alan et Rose ont une brève aventure. Charlie Sheen a été nommé pour un Golden Globe Award dans la catégorie du "Meilleur acteur dans une série télévisée musicale ou comique" pour sa performance hilarante dans cette deuxième saison. Charlie demande à Alan de laisser la maison libre afin qu'il puisse accueillir son cercle d'amis. Alan insiste pour rester : en vain. Le pauvre n'est pas au bout de ses peines : ses propres amis sont invités à une fête chez son ex-femme, Judith, mais là encore, Alan n'est pas le bienvenu...