Soupçonnant une tentative d'attaque bactériologique sur le quartier général des Marines à la frontière mexicaine, Sam et Callen partent enquêter sous couverture à Tijuana. Sur place, ils se font passer pour les propriétaires d'un snack ambulant et peuvent compter sur la collaboration de Paola Fuentes. De leur côté, Kensi et Deeks découvrent l'existence de tunnels souterrains utilisés par les cartels pour passer du Mexique aux Etats-Unis...