Cybertron, une planète habitée par des robots équipés de dispositifs qui leur permettent de se transformer en véhicules et alimentés par une substance appelée "energon". Dans la cité d'Iacon, Orion Pax et D-16, les futurs Optimus Prime et Mégatron, deux robots employés dans une mine d'energon, découvrent un indice qui pourrait leur permettre d'élucider la disparition de la "Matrice du Commandement". Leur quête les mène à la surface de leur planète, accompagnés de deux compères, B-127, alias "Bumblebee", et Elita. Déterminés, Orion Pax et D-16 poursuivent leurs recherches malgré les risques encourus et finissent rapidement par provoquer une véritable révolution...