Le NCIS surveille de près un navire qui se dirige vers Norfolk. D'après les renseignements obtenus, le bateau contiendrait dans sa cargaison des explosifs et des armes destinés à un marché parallèle et illégal. Tony et Ziva, qui sont chargés de rester en planque, disparaissent mystérieusement. Le NCIS entame aussitôt des recherches et craint que les trafiquants n'aient eu vent de l'enquête en cours sur leurs activités. Prisonniers, Tony et Ziva font tout pour se libérer. Ils savent que leurs collègues ne sont pas loin. Avec l'aide de McGee et d'un fonctionnaire du port, Gibbs tente tout pour retrouver ses amis. Il lance une localisation GPS...