Nicolas Hulot remonte le Nil à la découverte de l'histoire du Soudan. L'archéologue française Nassera Zaïd lui fait d'abord découvrir Méroé, la nécropole des pharaons noirs, tandis qu'une équipe d'"Ushuaïa" rencontre le peuple d'agriculteurs-éleveurs qui vit au pied des monts Nouba. A Napat, Nicolas croise ensuite la route de l'égyptologue Claude Rilly, spécialiste de l'écriture méroïtique.