L'humanité entière subit les conséquences de la catastrophe d'Isla Nublar survenue quatre années plus tôt. Désormais, les dinosaures commencent à dangereusement se rapprocher des villes après avoir rapidement repeuplé les forêts. De plus, des entreprises peu scrupuleuses s'intéressent de près à ces animaux d'une autre époque. Claire parvient à convaincre Owen de sortir de sa retraite dans les bois et d'intervenir avant qu'il ne soit trop tard. Accompagnés du docteur Malcolm, ils vont tenter de trouver une solution qui leur permettrait de faire d'une pierre deux coups : anéantir ces dangereux ennemis, et sauver la race humaine...