Avec l'aide de Carly, sa ravissante petite amie, Sam réussit à se faire embaucher dans l'entreprise d'aéronautique que dirige Bruce Brazos, à Washington. Parallèlement, Optimus Prime et les Autobots débarquent sur la Lune dans l'intention d'étudier de près l'épave de l'Arche, un vaisseau spatial qui s'est échoué quelques années plus tôt. Ils y retrouvent leur ancien chef, Sentinel Prime. Celui-ci est dans un état piteux, mais cela ne décourage pas Optimus de tenter de le ramener à la vie. Un certain Jerry prend contact avec Sam et le met en garde : des jours sombres se préparent. Jerry n'a que le temps de confier des documents avant d'être assassiné...